Platform for Drug Discovery


TopHat2, CuffLinks2 and CummeRbound + GE (SE)


詳細は ペアエンド(PE)のページ を参照してください。


    ただし、下記のように入力ファイルの注意点は一部異なります。

Inputs


  • ファイルはシングルエンドのFASTQファイルを2~10サンプルの範囲で入力可能です。
  • FASTQについては、こちらのページをご覧ください。
  • アップロードするファイル名にスペース「 」や、カッコ「(」、クオーテーション「'」などといった文字や日本語は使えません。(アップロードできても、解析時にエラーになります。) アルファベット+数字+アンダーバー「_」で名前を付けてください。
  • 各FASTQファイルがそれぞれ50GB以下であれば、経験的には当サーバで解析可能です。ただし、ファイルサイズによって、解析時間が延びるため、手早く結果を見るには、それぞれ数GB程度の大きさにダウンサンプリングするとよいかもしれません。