Platform for Drug Discovery


アプリケーションリスト


    このページのコンテンツはNGS現場の会(external link)の全面的な協力を得て作られています。ノウハウの共有など様々な情報交換が行われるNGS現場の会にこれを機会に参加することをご検討ください。

アセンブル

  • de novoアセンブリ
  • トランスクリプトームアセンブリ
  • メタゲノム解析

トランスクリプトーム解析

  • 発現解析
  • スプライシングバリアント解析
  • ncRNA・smallRNA解析

SAMTOOLS,ANNOVARを用いたexome解析チュートリアル

  • エキソーム解析

メチレーション解析

  • sodium bisulfite処理による解析
    • RRBS処理解析
    • BC–seq処理解析
    • BSPP処理解析
    • WGSBS処理解析
  • Affinity enrichmentを用いた解析
    • MeDIP処理解析
    • MIRA–seq
  • enzyme digestionを用いた解析
    • Methyl–seq処理解析
    • MCA–seq処理解析
    • HELP-Seq処理解析
    • MSCC

クロマチン解析

  • FAIRE-seq解析
  • MAINE-seq解析
  • MNase-seq解析
  • ChIP-seq解析
  • 転写因子解析
  • ChIP-Seq解析

核内3D構造解析

  • HiC-seq解析
  • 3c-seq解析
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