Platform for Drug Discovery


フォーマット



データの共通フォーマット


配列フォーマット関連

各種アノテーション

マッピング結果フォーマット関連

発現情報関連

多型解析

ネットワーク関連

その他フォーマット

  • CIGAR:SAMにも使用されるアライメント関連情報の記述形式
  • WIG:ゲノムブラウザで連続量を表現する際に使用する形式
  • MAF:マルチプルアライメント用
  • DNAモチーフのフォーマット
    • TRANSFAC,TRANSFAC-like,Raw PSSM,Jaspar/Consite,MEME output,Consensus sequence,Sequence Alignment,XMSのフォーマットの説明。
    • SOMBRERO,BioProspector or CompareProspector,MDscan,AlignACE,MEME (text file output),Weeder,MotifSampler,YMF,ANN-Spec (command-line only),Consensus (command-line only),Improbizer,Co-Bind,DME or CREAD,NestedMICAを含む各種ツールの出力する書式

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