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BEDOPSインストールログ

1.参照:
https://github.com/bedops/bedops

2.手順:
$ wget "https://github.com/bedops/bedops/releases/download/v2.4.3/bedops_linux_x86_64-v2.4.3.tar.bz2" -O bedops_linux_x86_64-v2.4.3.tar.bz2 --no-check-certificate
$ bunzip2 bedops_linux_x86_64-v2.4.3.tar.bz2
$ mkdir bedops_linux_x86_64-v2.4.3
$ cp bedops_linux_x86_64-v2.4.3.tar   bedops_linux_x86_64-v2.4.3
$ cd bedops_linux_x86_64-v2.4.3
$ tar xvf bedops_linux_x86_64-v2.4.3.tar
$ cd ..
$ cp -r bedops_linux_x86_64-v2.4.3 /tool_path/

3.パスの通じ
    • 環境の変数に、以下の物を追加
 ※gtf2bedコマンドは、内部的にconvert2bedを呼ぶため、パスを通していないと
  エラーが発生する場合がある。
PATH=/tool_path/bedops_linux_x86_64-v2.4.3:${PATH}


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