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DESeqとDESeq2 (R package)のインストールログ

参照 
http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/DESeq.html(external link)
http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/DESeq2.html(external link)


インストール手順:
1. DESeqのインストール
$ cd /install_path/R-2.15.2/bin
$ ./R
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("DESeq")
> q()

※ R-2.15.2のライブラリーにインストールしました。


2. DESeq2のインストール
$ cd /install_path/R-2.15.2/bin
$ ./R
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
Bioconductor version 2.11 (BiocInstaller 1.8.3), ?biocLite for help
> biocLite("DESeq2")
BioC_mirror: http://bioconductor.org
Using Bioconductor version 2.11 (BiocInstaller 1.8.3), R version 2.15.
Installing package(s) 'DESeq2'
 警告メッセージ:
package ‘DESeq2’ is not available (for R version 2.15.2)
> q()

※ R-2.15.2のライブラリーにインストール出来ません。

3.Pipeline環境のDefaultのR-2.14に、両方ともインストール
$ R
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("DESeq")
> biocLite("DESeq2")
> q()

※ Pipeline環境で、DefaultのR-2.14にインストールしました。



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