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ExAltインストールログ

参照
http://www.cbcb.umd.edu/software/exalt/index.shtml(external link)

インストール手順
$ cd /work_path/
$ wget http://cbcb.umd.edu/software/exalt/exalt-1.0.0.tar.gz
$ tar xzvf exalt-1.0.0.tar.gz
$ cp -r exalt-1.0.0 /install_path/
$ cd /install_path/exalt-1.0.0/

compileエラーの対応、以下のファイル先頭に「#include <assert.h>」に追加
src/lib/src/Kmer.cpp
src/bioinfo/string/impl/cidx.hpp
src/main/Options.cpp
src/main/ModelType.hpp
src/main/ConsHmm.cpp
src/main/GeneList.cpp
src/main/GffFeature.cpp
src/main/SeqLabel.cpp

$ cd src/main
$ make

※上のように、「/install_path/exalt-1.0.0/」に、インストールしました。

※実行ファイルは、「/install_path/exalt-1.0.0/src/main/exalt」です。


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