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PHYMMBLインストールログ

参照
http://www.cbcb.umd.edu/software/phymm(external link)
インストール手順
$ cd /work_path/
$ mkdir  phymmbl-20120901
$ cd  phymmbl-20120901
$ wget http://www.cbcb.umd.edu/software/phymm/phymmbl_installer.tar.gz
$ tar xzvf phymmbl_installer.tar.gz
$ cd ..
$ cp -r phymmbl-20120901 /install_path/
$ cd /install_path/phymmbl-20120901
$ cd .scripts/.icmCode/
$ tar xzvf glimmer3_plusSS.tgz 
$ cd SimpleMake/
$ cp delcher_newgcc.hh delcher.hh
$ cp gene_newgcc.cc gene.cc
$ cp icm_newgcc.cc icm.cc
$ make
$ cd ../../../
$ perl phymmblSetup.pl


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