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SOAPecインストールログ

参照 http://soap.genomics.org.cn/soapdenovo.html(external link)


インストール手順:
$ cd /work_path
$ wget  http://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/files/ErrorCorrection/SOAPec_src_v2.03.tgz/download
$ tar xzvf SOAPec_src_v2.03.tgz
$ cd SOAPec_src_v2.03
$ export PATH=/tool_path/gcc-4.8.1/bin:$PATH
$ export LD_LIBRARY_PATH=/tool_path/gcc-4.8.1/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
$ make
$ PREFIX=/tool_path/SOAPec_src_v2.03/ make install


環境の変数に、/tool_path/SOAPec_src_v2.03/bin を追加
gccが4.1.2, 4.7.3ではmakeに失敗。4.8.1で成功。


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