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ScanProsite toolのインストールログ

参照
http://prosite.expasy.org/scanprosite/scanprosite-doc.html(external link)

インストール手順:
$ cd /work_path/
$ mkdir ps_scan-20121029
$ cd ps_scan-20121029/
$ wget ftp://ftp.expasy.org/databases/prosite/ps_scan/ps_scan_linux_x86_elf.tar.gz
$ wget ftp://ftp.expasy.org/databases/prosite/prosite.dat
$ tar xzvf ps_scan_linux_x86_elf.tar.gz 
$ mv prosite.dat ps_scan/.
$ cp -r ps_scan /tool_path/ps_scan-20121029
$ cd /tool_path/ps_scan-20121029
$ vi ps_scan.pl

以下のように、修正
#my $PFSCAN  = 'pfscan';
#my $PSA2MSA = 'psa2msa';
my $PFSCAN  = '/tool_path/ps_scan-20121029/pfscan';
my $PSA2MSA = '/tool_path/ps_scan-20121029/psa2msa';

上のように、「/tool_path/ps_scan-20121029/」に、インストールしました。

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