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ea-utilsインストールログ

ea-utilsは、NGSデータ(fastqやbam)を扱うお役立ちツールです。 1. BamTools の確認
2. gcc-4.7.0を用いてコンパイルを実行(gcc-4.1.2では、エラーでコンパイルできなかったため)
3. パスの設定

$ export PATH=/tool_path/gcc-4.7.0/bin:${PATH}
$ export LD_LIBRARY_PATH=/tool_path/gcc-4.7.0/lib64:${LD_LIBRARY_PATH}
$ export LD_RUN_PATH=${LD_LIBRARY_PATH}
$ cd /work_path
$ wget https://ea-utils.googlecode.com/files/ea-utils.1.1.2-537.tar.gz
$ tar ea-utils.1.1.2-537.tar.gz
$ cd ea-utils.1.1.2-537
$ mkdir /install_path/ea-utils.1.1.2-537
$ PREFIX=/install_path/ea-utils.1.1.2-537 make install


共通PATHに、以下の物を追加
/tool_path/ea-utils.1.1.2-537/bin

以上のように、「/tool_path/ea-utils.1.1.2-537」にインストールしました。

Last edited by nomonma .
Page last modified on 日曜日 11 of August, 2013 16:20:13 JST.