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miso (C version)のインストールログ

参照
http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/#installing-the-fastmiso-version-of-miso(external link)

インストール手順:
1.simplejsonのインストール
$ cd /work_path/
$ wget http://pypi.python.org/packages/source/s/simplejson/simplejson-3.0.7.tar.gz
$ tar xzvf simplejson-3.0.7.tar.gz 
$ cd simplejson-3.0.7
$ python setup.py install


2.MISOのインストール
https://github.com/yarden/MISO/zipball/fastmiso」より、ZIPしたソースファイルをDOWNLOAD、サーバに置く(external link)
$ unzip yarden-MISO-6526162.zip 
$ cd yarden-MISO-6526162 
$ make Pythonpackage
$ python setup.py install --prefix=/tool_path/MISO-6526162


環境の変数PYTHONPATHに、 以下の
MISO_PATH=/tool_path/MISO-6526162/lib/python2.6/site-packages
PYTHONPATH=${MISO_PATH}:${PYTHONPATH}


3.インストールのチェック
$ cd /tool_path/MISO-6526162/bin
$ python module_availability.py
......

上のように、「/tool_path/MISO-6526162」にインストールしました。
実行ファイルは「/tool_path/MISO-6526162/bin」のしたに置く

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