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sickleのインストールログ

参照
https://github.com/najoshi/sickle(external link)
インストール
$ cd /work_path
$ wget https://github.com/najoshi/sickle/archive/master.zip --no-check-certificate
$ unzip master
$ cd sickle-master/
$ make

動作確認(バージョンの確認)
$ ./sickle --version
sickle version 1.210
Copyright (c) 2011 The Regents of University of California, Davis Campus.
sickle is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
Distributed under the MIT License.

Written by Nikhil Joshi, UC Davis Bioinformatics Core

$ cd ..
$ mv sickle-master sickle-1.210
$ cp -r sickle-1.210  /install_path/
$ cd /install_path/sickle-1.210
不要なファイルを削除
$ rm -rf Makefile sickle.o sickle.xml src/ sliding.o trim_paired.o trim_single.o test/

※上のように、「/install_path/sickle-1.210」にインストールしました。


Last edited by nomonma .
Page last modified on 日曜日 11 of August, 2013 14:06:20 JST.