TopHat2, CuffLinks2 and CummeRbound + GE (SE)

詳細は　ペアエンド(PE)のページ　を参照してください。

ただし、下記のように入力ファイルの注意点は一部異なります。

Inputs

• ファイルはシングルエンドのFASTQファイルを2～10サンプルの範囲で入力可能です。
• FASTQについては、こちらのページをご覧ください。
• アップロードするファイル名にスペース「 」や、カッコ「(」、クオーテーション「'」などといった文字や日本語は使えません。(アップロードできても、解析時にエラーになります。)　アルファベット＋数字＋アンダーバー「_」で名前を付けてください。
• 各FASTQファイルがそれぞれ50GB以下であれば、経験的には当サーバで解析可能です。ただし、ファイルサイズによって、解析時間が延びるため、手早く結果を見るには、それぞれ数GB程度の大きさにダウンサンプリングするとよいかもしれません。