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Pipeline Detail

解析パイプラインの入出力データセットと解析モジュールの一覧です。
データセットのアイコンをクリックするとデータのダウンロードや解析レポートの表示、Genome Explorerの起動などが行えます。
解析モジュールをクリックすると解析内容の詳細を閲覧できます。
Request ID: DP00044606 Status: End
Pipeline ID: P000001193 Request Date: 2013/02/16 21:07
Pipeline Name: GATK-UnifiedGenotyper-snpEff (hg19 only) [IN: bam (max 10)] Start Date: 2013/02/16 21:08
Pipeline Summary: Call genomic variants with GATK; thereafter add annotation including prediction with snpEff. This is for human hg19(hs37d5) use only. End Date: 2013/02/16 22:48
Input Dataset:
(DS00148703)

(DS00148705)
Output Dataset:
(indel.important.vcf)(DS00148765)

(snp.important.vcf)(DS00148764)

(snp_indel.snpEff.vcf)(DS00148763)

(indel.vcf)(DS00148762)

(snp.vcf)(DS00148761)

(DS00148766)

(DS00148767)
vcf
(snp_inde... (DS00148763)
vcf
(snp.impo... (DS00148764)
vcf
(snp.vcf) (DS00148761)
vcf
(indel.vc... (DS00148762)
downloadable
(DS00148767)

GATK UnifiedGen...
vcf
(indel.im... (DS00148765)
html
(DS00148766)
bam
(DS00148705)
bam
(DS00148703)