Cell Innovation

Project Detail

データの処理過程の流れを図示しています。表示の粒度は「パイプライン単位での表示」と、より詳細な粒度の「モジュール単位での表示」を切り替えることができます。それぞれのアイコンをクリックすると詳しい情報が表示され、解析レポートやゲノムビューワの閲覧、データのダウンロードなどを行うことができます。
ProjectID Title Description Application Type Genome App Date Applicant
PJ00000115 P000001080: TopHat2, CuffLinks2 and CummeRbund + GE (PE, with detection of de novo splicing variants) WGS human 2013/02/27 kyoshita
パイプライン単位で表示モジュール単位で表示
expression table
gene
(DS00141928)

loadBAM2ge_db (...

loadBAM2ge_db (...

loadBAM2ge_db (...

Utility: Annota...

Utility: Annota...

TopHat2, CuffLi...
html
Report
(DS00142663)

reference ...
(DS00142661)

white_bloo...
(DS00142309)

loadBAM2ge_db (...

loadBAM2ge_db (...

heart_male...
(DS00142293)

kidney_fem...
(DS00142291)

gtfToGenePred

transcript...
(DS00142655)

Utility: Annota...

Utility: Annota...
genePred(standard)
transcript...
(DS00142651)
genePred(standard)
reference ...
(DS00142657)
downloadable
kidney_fem...
(DS00141908)
downloadable
heart_male...
(DS00141909)
downloadable
thyroid_fe...
(DS00141906)
downloadable
ovary_fema...
(DS00141907)

loadGenePred(st...

gtfToGenePred
fastq (paired-end)
white_bloo...
(DS00141152)

loadGenePred(st...
fastq (paired-end)
heart_male...
(DS00141150)

thyroid_fe...
(DS00142281)

ovary_fema...
(DS00142289)

create TopHat-C...
fasta (nucleotide)
reference ...
(DS00141915)
gtf
reference ...
(DS00141916)
expression table
gene
(DS00141913)
expression table
isoform
(DS00141914)
gtf
CuffLinks ...
(DS00141911)
html
isoform
(DS00142649)
downloadable
CuffDiff a...
(DS00141912)
downloadable
white_bloo...
(DS00141910)
html
gene
(DS00142273)
fastq (paired-end)
ovary_fema...
(DS00141148)
fastq (paired-end)
thyroid_fe...
(DS00141146)
fastq (paired-end)
kidney_fem...
(DS00141144)
bam
heart_male...
(DS00141904)
bam
white_bloo...
(DS00141905)
bam
ovary_fema...
(DS00141902)
bam
kidney_fem...
(DS00141903)
bam
thyroid_fe...
(DS00141901)
expression table
isoform
(DS00142318)