Cell Innovation

Project Detail

データの処理過程の流れを図示しています。表示の粒度は「パイプライン単位での表示」と、より詳細な粒度の「モジュール単位での表示」を切り替えることができます。それぞれのアイコンをクリックすると詳しい情報が表示され、解析レポートやゲノムビューワの閲覧、データのダウンロードなどを行うことができます。
ProjectID Title Description Application Type Genome App Date Applicant
PJ00000144 P000001190: BWA and GATK + GE (human (hs37d5) only, PE) [IN: fastq (paired-end) (max 10)] WGS human 2013/03/01 kyoshita
パイプライン単位で表示モジュール単位で表示

make a bam list...
vcf
gatk.recal...
(DS00151235)
vcf
gatk.recal...
(DS00151236)

Ovarian ca...
(DS00151174)

GATK UnifiedGen...

BWA for GATK (h...

BWA for GATK (h...
vcf
gatk.recal...
(DS00151237)

BWA for GATK (h...
vcf
gatk.recal...
(DS00151238)
bam
Ovarian ca...
(DS00150886)

BWA for GATK (h...
vcf
gatk.recal...
(DS00151239)
bam
Ovarian ca...
(DS00150887)

Ovarian ca...
(DS00151217)
fastq (paired-end)
Ovarian ca...
(DS00141412)
html

(DS00151509)

Ovarian ca...
(DS00151093)
fastq (paired-end)
Ovarian ca...
(DS00141419)
bam
Ovarian ca...
(DS00151024)

merge GE links
bam
Ovarian ca...
(DS00151025)
bam
Ovarian ca...
(DS00150971)
bam list

(DS00151225)
bam
Ovarian ca...
(DS00150972)
html
sneEff sum...
(DS00151240)
downloadable
tree and p...
(DS00151241)
bam
Ovarian ca...
(DS00150856)

loadBAM2ge_db (...

loadBAM2ge_db (...

loadBAM2ge_db (...

loadBAM2ge_db (...
bam
Ovarian ca...
(DS00150855)

Ovarian ca...
(DS00151207)

vcf to tab deli...
fastq (paired-end)
Ovarian ca...
(DS00141421)
downloadable
gatk.recal...
(DS00167795)
fastq (paired-end)
Ovarian ca...
(DS00141420)