Cell Innovation

Project Detail

データの処理過程の流れを図示しています。表示の粒度は「パイプライン単位での表示」と、より詳細な粒度の「モジュール単位での表示」を切り替えることができます。それぞれのアイコンをクリックすると詳しい情報が表示され、解析レポートやゲノムビューワの閲覧、データのダウンロードなどを行うことができます。
ProjectID Title Description Application Type Genome App Date Applicant
PJ00001390 P000001425: contig annotations and estimation of population size history (PE) WGS human 2013/10/10 kyoshita
パイプライン単位で表示モジュール単位で表示

samtools mpileu...

add BLASTX (uni...

make a bam list...
gff
clc assemb...
(DS00204650)
vcf
clc assemb...
(DS00204750)
downloadable
clc assemb...
(DS00204639)
fastq (paired-end)
SEQ.merged
(DS00204618)
bam
clc assemb...
(DS00204637)

AUGUSTUS

add BLASTN (NR)...

Make BWA index

bwa mem (PE)

fasta_formatter

mummerplot

GC_coverage_len...

PSMC
downloadable
clc assemb...
(DS00204642)

RepeatMasker
fasta (nucleotide)
clc assemb...
(DS00204644)
expression table
clc assemb...
(DS00204640)
expression table
clc assemb...
(DS00204662)
bwaDBIndex
clc assemb...
(DS00204628)
expression table
clc assemb...
(DS00204723)
downloadable
clc assemb...
(DS00204646)
fasta (nucleotide)
clc assemb...
(DS00204625)
bam list
clc assemb...
(DS00204725)
fasta (nucleotide)
clc assemb...
(DS00204648)