Cell Innovation

Project Detail

データの処理過程の流れを図示しています。表示の粒度は「パイプライン単位での表示」と、より詳細な粒度の「モジュール単位での表示」を切り替えることができます。それぞれのアイコンをクリックすると詳しい情報が表示され、解析レポートやゲノムビューワの閲覧、データのダウンロードなどを行うことができます。
ProjectID Title Description Application Type Genome App Date Applicant
PJ00001581 P000001169: Bowtie(SE) MACS2 GADEM MotIV ChIPpeakAnno (TE:FOXA1) ChIP-seq human 2013/11/26 demouser01
パイプライン単位で表示モジュール単位で表示
fasta (nucleotide)

(DS00219021)
html
QC.SRR5778...
(DS00218990)

summits.vi...
(DS00219001)
fastq (single-end)
SRR577663
(DS00117850)
original

(DS00219020)

Bowtie (SE)

loadBAM2ge_db (...

phantompeakqual...
bam
SRR577663
(DS00218954)

MACS2 with cont...

peaks.view
(DS00218999)
GADEM output PWM
PWM
(DS00219009)
bed
peaks
(DS00218992)
html
ANNOTATION
(DS00219025)
bed
summits
(DS00218993)

Bowtie (SE)

SRR577861....
(DS00218950)
html
PEAK_REP
(DS00218994)

loadBAM2ge_db (...
ENCODE narrowPeak
peaks(enco...
(DS00218995)
fastq (single-end)
SRR577861
(DS00117844)
html
DENOVO_MOT...
(DS00219011)

loadBED2ge_db
Multi raw sequences
SEQ
(DS00219010)

loadBED2ge_db

GADEM de novo m...
original

(DS00219019)
bam
SRR577861
(DS00218942)

SRR577663....
(DS00218964)

Search motif wi...
html
KNOWN_MOTI...
(DS00219014)

ChIPpeakAnno

HTML Report fo...