Cell Innovation

Project Detail

データの処理過程の流れを図示しています。表示の粒度は「パイプライン単位での表示」と、より詳細な粒度の「モジュール単位での表示」を切り替えることができます。それぞれのアイコンをクリックすると詳しい情報が表示され、解析レポートやゲノムビューワの閲覧、データのダウンロードなどを行うことができます。
ProjectID Title Description Application Type Genome App Date Applicant
PJ00002053 SNP, INDEL calling WGS human 2014/03/19 kyoshita
パイプライン単位で表示モジュール単位で表示

snpEff (custom ...

GATK HaplotypeC...
vcf
mpileup
(DS00247618)

make a bam list
bam list

(DS00247605)
html

(DS00247668)
vcf
GATK Haplo...
(DS00247679)
fastq (paired-end)
DRR001444
(DS00177908)
bam
DRR001444
(DS00247602)

bwa mem (PE)

bwa mem (SE)
bam
DRR001447
(DS00247556)

samtools mpileu...
vcf
mpileup (...
(DS00247667)
fastq (single-end)
DRR001447
(DS00177909)

Make BWA index
bwaDBIndex
dm3.bwa.in...
(DS00247474)
downloadable
GATK Haplo...
(DS00247680)
fasta (nucleotide)
dm3
(DS00234789)
gtf
dm3ensGene
(DS00238069)