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BAM2SAM変換フロー

1. 説明

    • マッピング結果ファイルのBAM形式を解凍しSAM形式に変換します。

2. フロー図

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3. 詳細

3.1. サブフロー

3.2. コマンド

      • BAM2SAM変換
        • tool=/commonDir/ tool/samtools-0.1.7a/samtools
          $tool view -h $inputBam > $outputSam
      • 使用するプログラム
      • 変数
        • 変数名図中の表記説明
          inputBamマップ結果(BAM)入力に使用するBAMファイルのパスを指定します。
          outputSamマップ結果(SAM)出力に使用するSAMファイルのパスを指定します。

3.3. データフォーマット


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